Ako radiš instalaciju "od nule" najbolje je da prilikom instalacije sa butabilnog CD-a ukineš postojeće particije i kreiraš nove (ako želiš da imaš više particija), a u protivnom jednostavno da odabereš da se Windows instalira na "Unallocated space" i prepustiš dalji tok instalacionoj proceduri. Nemoj da koristiš nikakve dodatne programe za prethodno formatiranje diska!
Ako se pak instalacija ne radi "od nule", automatizovana konverzija iz FAT32 u NTFS je moguća iz samog Windowsa bez rizika od gubitka podataka (mada se backup uvek preporučuje). Za XP NTFS je "prirodno i preporučeno okruženje" da ne ulazimo sada ovde u još jednu beskonačnu diskusiju FAT32 vs NTFS!
PS
Ako ti nešto znači, moj računar ima 2 hard diska: 160GB i 80GB i oba su pod NTFS bez ikakvih particija svaki je "u komadu". Na jednom imam XP SP3, a na drugom Vista Ultimate SP1
;)